С 80-х годов коллектив специалистов по устьям рек стал уделять больше внимания разработке и усовершенствованию методов расчета изменений гидролого-морфологических процессов в устьевых областях рек под влиянием естественных и антропогенных факторов: были даны теоретические обоснования и разработан автоматизированный метод построения и оценки точности связей расходов и уровней воды в устьях рек по гидрометрическим данным; предложены новые схемы расчета расходов и уровней воды в дельтах рек гидравлико-морфометрическим методом;
разработана математическая модель для прогнозирования развития системы дельтовых водотоков; разработана методика расчета проникновения морских вод в устья рек.
Обобщающим трудом устьевых исследований явилась монография „Гидролого-морфологические процессы в устьях рек и методы их расчета (прогноза)" (В.Ф. Полонский, Ю.В. Лупачев, Н.А. Скриптунов, 1992 г.), где устьевая область реки впервые рассматривается комплексно, с точки зрения системного подхода к сложному физико-географическому объекту.
Значителен вклад устьевиков ГОИН в эти работы: С.С. Байдина. Г.Н. Ган, М.Н. Зотина, М.Н. Костяницына, Ю.В. Лупачева. В.Н. Михайлова, Т.М. Макаровой, Я.Д. Никифорова, В.Ф. Полонского, М.М. Рогова, Н.А. Родионова, И.В. Самойлова, А.И. Симонова, Н.А. Скриптунова, а также многих других ученых и специалистов.